温州理工学院创新创业学院前身为温州大学瓯江学院创业中心，成立于2002年11月，后更名为创业就业工作办（部）。为强化创新创业教育工作，依据省教育厅有关文件精神，2015年11，原已经实体化运作的创业就业工作部正式更名为温州大学瓯江学院创业学院，创业学院院长兼任瓯江学院创新创业工作领导小组办公室主任，协调各相关部门开展创业教育工作，形成创业学院、教务部、学工部、团委、科研、科研、人事等多部门协同参与的常态化工作机制。创业学院行使瓯江学院创新创业教育工作职能，开展创新创业教学与研究、学生创业实践与实训、创业项目培育与推广、创业班级建设与管理、创新创业竞赛与组织等事务，创业学院下设创业教育工作办公室、创新创业教育研究室和创业园（众创空间）管理办公室，指导学院学生创业联盟、学生创业促进会、大学生创新创意俱乐部等学生组织与社团。2021年，学校转设为温州理工学院，创业学院更名为温州理工学院创新创业学院。